哈尔滨海关为海关总署垂直管理的正厅级直属海关，负责黑龙江省范围内海关工作运行管理、监督监控。主要职责是：负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，执行与海关管理相关的法律、法规、规章、规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、缉私、统计、出入境检验检疫等工作；监控研判本关区各类执法风险、管理风险和廉政风险并组织防范和化解，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作；完成海关总署交办的其他工作。

       哈尔滨海关机关内设处级机构18个，下设副厅级缉私局和隶属海关单位1个，正处级隶属海关单位20个，设有10个党委派驻纪检组。

       哈尔滨海关辖区幅员辽阔，与俄罗斯联邦边境线长2981公里，口岸分布点多线长面广，“水、路、空、铁、管、网、邮、索”监管门类众多，特色鲜明。近年来，哈尔滨海关以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，坚决贯彻海关总署党委和黑龙江省委、省政府各项决策部署，积极锻造“政治坚定、业务精通、令行禁止、担当奉献”的准军事化纪律部队，高效统筹疫情防控和促外贸保稳提质，各项工作取得了显著成效，为黑龙江省经济社会发展做出了积极贡献。